Un plan de métro pour nos gènes

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Publié 14/10/2016 par Agence Science-Presse

Cette carte, qui ressemble à un plan de métro, est en fait une carte géographique de votre génome.

On pourrait croire qu’il s’agit d’un outil d’éducation populaire, mais elle s’inscrit au contraire dans une quête des généticiens pour se faciliter la tâche.

Ces 15 dernières années, alors qu’on avait dressé la liste des gènes de plus en plus d’individus, les scientifiques se retrouvaient face à un dilemme: mettre simplement les génomes côte à côte sur un écran d’ordinateur, à la recherche des différences, devenait une méthode d’une autre époque.

Benedict Paten, un bioinformaticien de l’université de Californie, est parti d’un concept qui a lui aussi fait son chemin ces 15 dernières années: notre génome n’est pas juste un long fil de gènes, mais un réseau de gènes, ou plus exactement, un réseau de séquences de gènes.

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L’idée consiste donc à dresser une carte «modèle» de ce réseau, à partir d’un millier de génomes différents. La version 1.0 devrait être publiée en accès libre en 2017. Les différences génétiques entre différentes personnes seront plus faciles à visualiser sur une telle carte — un peu comme un itinéraire pour lequel Google nous propose plusieurs choix.

L’idée, en soi, n’est pas nouvelle, mais il fallait avoir accumulé quelques milliers de génomes pour qu’on reconnaisse son utilité.

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